寄生虫基因组鉴定平台上线

作者：张嘉尧审稿人：曹俊来源：丝蠕虫病室发布时间：2023-11-22 访问量：1080

近日，江苏省血吸虫病防治研究所开发的寄生虫基因组鉴定平台（Parasite Genome Identification Platform, PGIP）正式上线。

PGIP由国家重点研发计划项目资助，江苏省血吸虫病防治研究所设计开发、运维并提供技术支持。平台部署于江苏省血吸虫病防治研究所超融合计算平台，搭配DRAGEN基因组数据超高速分析系统，对于20G的测序数据，平台最快可在1.5小时内完成鉴定。

PGIP的参考寄生虫基因数据库，包括95种原虫、162种蠕虫，共257种寄生虫参考基因组，且数据库将实时更新。平台操作界面为图形化界面，用户上传所需分析的测序文件后，根据页面指引，点击申请分析，平台即开始分析。平台可自动对数据进行质量控制、拼接、比对等操作，对样本中可能存在的寄生虫感染进行快速检测，当分析完成后即可下载鉴定报告。

PGIP不仅能辅助临床诊断，为采取相应的治疗措施提供参考，还可为寄生虫病防治、科研等提供相关服务。平台后续将继续优化鉴定流程并陆续更新其他分析功能。

目前，PGIP已正式上线，欢迎各单位上传未知寄生虫虫种的基因组测序数据进行分析鉴定。PGIP平台作为计算平台，所有的数据权利属于数据提供方，平台不使用用户数据发表任何科研论文。

平台地址：http://pgip.jipd.com:8030/f

联系人：张老师

邮箱：src@jipd.com

寄生虫基因组鉴定平台上线

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