目前在研课题共45项，包括国家"863""973"计划、国家自然科学基金、国家"十五攻关"项目，江苏省自然科学基金、世界卫生组织热带病研究特别规划署项目，英国Wellcome trust 基金项目、美国国立卫生研究院资助项目、疟疾全球基金项目、卫生部重点科研项目以及其他20余项研究课题。全所累计获科技成果奖50余项，其中国家级7项，部省级20余项。